TotalSegmentator: скилл выбора задач сегментации
Официальный скилл учит агента находить доступные классы через MCP, выбирать задачу, устройство и режим скорости, а затем фиксировать маски и настройки запуска.
Весь набор в одном ZIP
Один ZIP: скиллы, инструкции, установщик и запуск публичного демо.
Когда пригодится
Выбрать точные классы и совместимую задачу
Подготовить сегментацию открытого КТ-примера
Зафиксировать параметры, маски и ограничения статистики
Что получите
Явно выбранная операция и журнал результатов; маски появляются только после реального запуска отдельно установленного MCP-сервера.
Например
Подготовь сегментацию открытого КТ-примера: через MCP проверь доступные классы и задачу, выбери устройство и скорость. До запуска перечисли настройки и ожидаемые загрузки. Отдели маски и статистику от медицинских выводов.
Перед запуском
Редакционная инструкция к официальному скиллу TotalSegmentator. Прежний запуск CLI из статьи не подтверждает работу этого MCP и скилла.
Изучите закреплённый SKILL.md и отдельную документацию MCP. Установите скилл из папки skills/totalsegmentator проверенной ревизии поддерживаемым способом.
Подготовьте отдельную среду TotalSegmentator с дополнением mcp и совместимым устройством. До установки уточните версии Python/PyTorch, место для весов и условия выбранной задачи.
Подключите локальный stdio-сервер. HTTP-режим в документации не имеет аутентификации; не публикуйте его в интернете.
Через MCP проверьте классы и параметры, затем укажите устройство, скорость, совместимый ROI и статистику. Первый инференс может скачивать веса.
На разрешённом открытом примере сохраняйте настройки, маски и исходный отчёт. Проверяйте совмещение и неполные структуры; выходы модели не являются клиническим заключением.
Оригинал, требования и ограничения
Оригинальный скилл и программа: команда TotalSegmentator, University Hospital Basel. Редакционная инструкция: kossolapov.com.
- Агент
- Агент с поддержкой Agent Skills и MCP-клиентом
- Инструменты
- Python, uv или pipx, PyTorch и отдельно установленная среда TotalSegmentator[mcp]
- Совместимое CPU/GPU/MPS-устройство, память, место на диске и доступ к весам
- Разрешённый открытый NIfTI-пример или поддерживаемый DICOM-вход и просмотрщик для проверки масок
- Доступы
- Для некоторых задач нужна отдельная лицензия TotalSegmentator; сначала проверьте выбранную задачу
- Возможные расходы
- Лицензируемые задачи и аренда вычислений могут быть платными; задача total обозначена Apache-2.0 в изученном README
- Ограничения
- Этот скилл и MCP изучены по исходникам и не запускались. Прежний запуск CLI 2.18.0 на примере — отдельное свидетельство.
- В изученной документации HTTP-режим MCP не имеет аутентификации; предпочтителен локальный stdio, либо HTTP только на loopback.
- Первый запуск может скачать веса. Пути относятся к машине MCP-сервера.
- Авторы описывают анонимную статистику использования и настройку send_usage_stats; перед работой проверьте передачу данных.
- Пустая маска патологии не исключает заболевание; неполные структуры искажают статистику. Выходы модели — оценки, а не клинические выводы.